В Медико-хирургической академии, несмотря на все то, что сделал для нее Петров в течение почти сорокалетней деятельности, труды его не были оценены, по крайней мере высшим начальством. При всяком благоприятном случае делались попытки уволить Петрова из Академии.
лейб-медик императора Александра I
баронет Вилие Яков Васильевич
Так, в 1830 г., когда у В. В. Петрова обнаружились катаракты глаз, вскоре благополучно удаленные, президент Медико-хирургической академии лейб-медик императора Александра I баронет Вилие Яков Васильевич известил Конференцию Академии (по современной терминологии - Ученый совет Академии) о необходимости увольнения Петрова из Академии ввиду его болезни и преклонных лет. Однако с этим мнением президента даже всегда послушная Конференция не согласилась и в специальном заявлении на имя президента ходатайствовала о воздержании от увольнения Петрова. В этот раз Петров удержался и даже в скором времени был представлен Конференцией к награждению орденом за многолетнюю ревностную службу. Однако президент Академии представление о награждении Петрова орденом не поддержал, а, наоборот, вскоре издал новый приказ об его увольнении. В этот раз Конференция, повидимому, не могла помочь Петрову, и он принужден был оставить преподавание в Медико-хирургической академии. Единственно, чего могла добиться Конференция Академии, - это утверждения Министром внутренних дел, в ведении которого находилась Медико-хирургическая академия, проф. В. В. Петрова почетным членом Медико-хирургической академии.
Даже смерть не примирила с Петровым высшего начальства Медико-хирургической академии.
Когда в 1834 г., после смерти Василия Владимировича Петрова, Конференция Академии ходатайствовала о назначении пенсии (www.soglasie-npf.ru) незамужней дочери Петрова, находившейся в бедственном положении, ссылаясь на «исключительно плодотворную работу покойного академика Петрова», президент Медико-хирургической академии в ходатайстве отказал, мотивируя отказ тем, что «во-первых, дочь Петрова совершеннолетняя и, во-вторых, что академик В. В. Петров последнее время служил не в Медико-хирургической академии, а при Академии наук», куда президент Медико-хирургической академии и рекомендовал дочери Петрова обратиться. Конечно, дочь Петрова пенсии так и не получила, несмотря на то, что непременный секретарь Академии наук доложил Конференции о действительно бедственном положении дочери академика Петрова. Несмотря на ходатайство Конференции о назначении пенсии, президент Академии наук в ходатайстве отказал.